Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MDH1P40925 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MDH1P40925 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MDH1P40925 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MDH1P40925 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MDH1P40925 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MDH1P40925 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MDH1P40925 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MDH1P40925 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MDH1P40925 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MDH1P40925 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MDH1P40925 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MDH1P40925 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MDH1P40925 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MDH1P40925 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MDH1P40925 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MDH1P40925 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MDH1P40925 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MDH1P40925 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MDH1P40925 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MDH1P40925 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MDH1P40925 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MDH1P40925 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MDH1P40925 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MDH1P40925 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MDH1P40925 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MDH1P40925 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MDH1P40925 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MDH1P40925 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MDH1P40925 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MDH1P40925 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MDH1P40925 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MDH1P40925 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MDH1P40925 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MDH1P40925 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MDH1P40925 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MDH1P40925 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MDH1P40925 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MDH1P40925 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MDH1P40925 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MDH1P40925 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MDH1P40925 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MDH1P40925 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MDH1P40925 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MDH1P40925 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MDH1P40925 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MDH1P40925 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MDH1P40925 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MDH1P40925 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MDH1P40925 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MDH1P40925 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MDH1P40925 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MDH1P40925 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MDH1P40925 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MDH1P40925 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MDH1P40925 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MDH1P40925 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
MDH1P40925 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MDH1P40925 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MDH1P40925 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MDH1P40925 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
MDH1P40925 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
MDH1P40925 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MDH1P40925 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
MDH1P40925 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MDH1P40925 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MDH1P40925 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MDH1P40925 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MDH1P40925 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MDH1P40925 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MDH1P40925 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MDH1P40925 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MDH1P40925 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MDH1P40925 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MDH1P40925 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MDH1P40925 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MDH1P40925 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MDH1P40925 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MDH1P40925 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MDH1P40925 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MDH1P40925 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MDH1P40925 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MDH1P40925 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
MDH1P40925 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
MDH1P40925 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MDH1P40925 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MDH1P40925 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MDH1P40925 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MDH1P40925 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MDH1P40925 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MDH1P40925 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MDH1P40925 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MDH1P40925 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MDH1P40925 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MDH1P40925 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MDH1P40925 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MDH1P40925 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MDH1P40925 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MDH1P40925 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MDH1P40925 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms