Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GGCXP38435 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GGCXP38435 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GGCXP38435 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GGCXP38435 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GGCXP38435 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GGCXP38435 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GGCXP38435 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GGCXP38435 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GGCXP38435 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GGCXP38435 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GGCXP38435 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GGCXP38435 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GGCXP38435 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GGCXP38435 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
GGCXP38435 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GGCXP38435 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GGCXP38435 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GGCXP38435 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GGCXP38435 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GGCXP38435 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GGCXP38435 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GGCXP38435 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GGCXP38435 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GGCXP38435 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GGCXP38435 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GGCXP38435 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GGCXP38435 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GGCXP38435 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GGCXP38435 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GGCXP38435 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GGCXP38435 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GGCXP38435 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GGCXP38435 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GGCXP38435 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GGCXP38435 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GGCXP38435 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GGCXP38435 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GGCXP38435 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GGCXP38435 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GGCXP38435 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GGCXP38435 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GGCXP38435 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GGCXP38435 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GGCXP38435 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GGCXP38435 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GGCXP38435 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GGCXP38435 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GGCXP38435 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GGCXP38435 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GGCXP38435 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GGCXP38435 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GGCXP38435 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GGCXP38435 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GGCXP38435 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GGCXP38435 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GGCXP38435 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GGCXP38435 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GGCXP38435 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GGCXP38435 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GGCXP38435 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GGCXP38435 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GGCXP38435 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GGCXP38435 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GGCXP38435 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GGCXP38435 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GGCXP38435 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GGCXP38435 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GGCXP38435 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GGCXP38435 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GGCXP38435 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
GGCXP38435 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
GGCXP38435 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GGCXP38435 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GGCXP38435 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GGCXP38435 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GGCXP38435 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GGCXP38435 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GGCXP38435 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GGCXP38435 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GGCXP38435 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GGCXP38435 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GGCXP38435 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GGCXP38435 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GGCXP38435 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GGCXP38435 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GGCXP38435 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GGCXP38435 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GGCXP38435 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GGCXP38435 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GGCXP38435 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GGCXP38435 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GGCXP38435 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GGCXP38435 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GGCXP38435 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GGCXP38435 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GGCXP38435 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GGCXP38435 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GGCXP38435 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GGCXP38435 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms