Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms