Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms