Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms