Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HOXD13P35453 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
HOXD13P35453 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD13P35453 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD13P35453 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD13P35453 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD13P35453 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD13P35453 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD13P35453 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD13P35453 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD13P35453 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD13P35453 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD13P35453 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD13P35453 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HOXD13P35453 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD13P35453 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD13P35453 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HOXD13P35453 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD13P35453 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD13P35453 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD13P35453 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD13P35453 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HOXD13P35453 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD13P35453 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD13P35453 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD13P35453 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD13P35453 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD13P35453 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD13P35453 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD13P35453 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD13P35453 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD13P35453 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD13P35453 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD13P35453 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD13P35453 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD13P35453 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD13P35453 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD13P35453 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD13P35453 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD13P35453 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD13P35453 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD13P35453 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD13P35453 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD13P35453 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms