Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms