Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP1P29466 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP1P29466 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP1P29466 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP1P29466 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP1P29466 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP1P29466 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP1P29466 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP1P29466 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP1P29466 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP1P29466 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP1P29466 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP1P29466 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP1P29466 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP1P29466 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP1P29466 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP1P29466 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP1P29466 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP1P29466 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP1P29466 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP1P29466 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP1P29466 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP1P29466 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP1P29466 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP1P29466 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP1P29466 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP1P29466 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP1P29466 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP1P29466 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP1P29466 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP1P29466 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP1P29466 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP1P29466 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP1P29466 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP1P29466 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP1P29466 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP1P29466 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP1P29466 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP1P29466 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP1P29466 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP1P29466 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP1P29466 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP1P29466 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP1P29466 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP1P29466 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP1P29466 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP1P29466 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP1P29466 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP1P29466 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP1P29466 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP1P29466 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP1P29466 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP1P29466 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP1P29466 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP1P29466 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP1P29466 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP1P29466 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP1P29466 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP1P29466 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP1P29466 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP1P29466 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP1P29466 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP1P29466 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP1P29466 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP1P29466 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP1P29466 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP1P29466 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP1P29466 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP1P29466 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP1P29466 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP1P29466 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP1P29466 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP1P29466 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP1P29466 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP1P29466 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP1P29466 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP1P29466 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP1P29466 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP1P29466 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP1P29466 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP1P29466 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP1P29466 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CASP1P29466 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CASP1P29466 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP1P29466 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP1P29466 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP1P29466 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP1P29466 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP1P29466 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP1P29466 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP1P29466 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP1P29466 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP1P29466 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP1P29466 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP1P29466 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP1P29466 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP1P29466 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP1P29466 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP1P29466 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP1P29466 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms