Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD34P28906 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD34P28906 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD34P28906 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD34P28906 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD34P28906 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD34P28906 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD34P28906 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD34P28906 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD34P28906 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CD34P28906 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD34P28906 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD34P28906 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CD34P28906 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CD34P28906 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CD34P28906 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD34P28906 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD34P28906 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD34P28906 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD34P28906 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD34P28906 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD34P28906 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD34P28906 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD34P28906 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD34P28906 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD34P28906 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CD34P28906 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD34P28906 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD34P28906 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD34P28906 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD34P28906 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD34P28906 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD34P28906 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD34P28906 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD34P28906 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD34P28906 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD34P28906 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD34P28906 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD34P28906 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD34P28906 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD34P28906 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CD34P28906 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD34P28906 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD34P28906 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD34P28906 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CD34P28906 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CD34P28906 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD34P28906 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD34P28906 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD34P28906 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD34P28906 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD34P28906 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CD34P28906 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD34P28906 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD34P28906 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD34P28906 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD34P28906 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD34P28906 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD34P28906 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD34P28906 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD34P28906 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD34P28906 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD34P28906 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD34P28906 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD34P28906 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD34P28906 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD34P28906 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD34P28906 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD34P28906 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD34P28906 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD34P28906 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD34P28906 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD34P28906 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD34P28906 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD34P28906 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD34P28906 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD34P28906 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD34P28906 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD34P28906 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CD34P28906 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CD34P28906 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD34P28906 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD34P28906 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD34P28906 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD34P28906 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD34P28906 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD34P28906 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD34P28906 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD34P28906 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD34P28906 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD34P28906 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD34P28906 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD34P28906 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD34P28906 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD34P28906 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD34P28906 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD34P28906 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD34P28906 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD34P28906 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD34P28906 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms