Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms