Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IL3RAP26951 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms