Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PLNP26678 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PLNP26678 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PLNP26678 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PLNP26678 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PLNP26678 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PLNP26678 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PLNP26678 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PLNP26678 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PLNP26678 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PLNP26678 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PLNP26678 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PLNP26678 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PLNP26678 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PLNP26678 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PLNP26678 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PLNP26678 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PLNP26678 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PLNP26678 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PLNP26678 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PLNP26678 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PLNP26678 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PLNP26678 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PLNP26678 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PLNP26678 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PLNP26678 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PLNP26678 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PLNP26678 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PLNP26678 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PLNP26678 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PLNP26678 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PLNP26678 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PLNP26678 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PLNP26678 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PLNP26678 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PLNP26678 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PLNP26678 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PLNP26678 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PLNP26678 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PLNP26678 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PLNP26678 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PLNP26678 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PLNP26678 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PLNP26678 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PLNP26678 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PLNP26678 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PLNP26678 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PLNP26678 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PLNP26678 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PLNP26678 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PLNP26678 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PLNP26678 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PLNP26678 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PLNP26678 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PLNP26678 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PLNP26678 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PLNP26678 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PLNP26678 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PLNP26678 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PLNP26678 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PLNP26678 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PLNP26678 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PLNP26678 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PLNP26678 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PLNP26678 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PLNP26678 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PLNP26678 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PLNP26678 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PLNP26678 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PLNP26678 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PLNP26678 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PLNP26678 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PLNP26678 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PLNP26678 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PLNP26678 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PLNP26678 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PLNP26678 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PLNP26678 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PLNP26678 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PLNP26678 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PLNP26678 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PLNP26678 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PLNP26678 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PLNP26678 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PLNP26678 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PLNP26678 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PLNP26678 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PLNP26678 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PLNP26678 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PLNP26678 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PLNP26678 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PLNP26678 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PLNP26678 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PLNP26678 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PLNP26678 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PLNP26678 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PLNP26678 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PLNP26678 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PLNP26678 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PLNP26678 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms