Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms