Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKCHP24723 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKCHP24723 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKCHP24723 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKCHP24723 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKCHP24723 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKCHP24723 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKCHP24723 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKCHP24723 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
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