Protein–RNA interactions for Protein: P23942

PRPH2, Peripherin-2, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPH2P23942 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRPH2P23942 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms