Protein–RNA interactions for Protein: P23435

CBLN1, Cerebellin-1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBLN1P23435 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBLN1P23435 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms