Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCP2P22307 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCP2P22307 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCP2P22307 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCP2P22307 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCP2P22307 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCP2P22307 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCP2P22307 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCP2P22307 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCP2P22307 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCP2P22307 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCP2P22307 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCP2P22307 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCP2P22307 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCP2P22307 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCP2P22307 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCP2P22307 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCP2P22307 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCP2P22307 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SCP2P22307 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCP2P22307 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCP2P22307 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCP2P22307 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCP2P22307 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCP2P22307 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCP2P22307 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCP2P22307 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCP2P22307 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCP2P22307 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCP2P22307 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCP2P22307 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCP2P22307 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCP2P22307 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCP2P22307 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCP2P22307 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCP2P22307 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCP2P22307 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCP2P22307 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCP2P22307 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCP2P22307 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCP2P22307 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCP2P22307 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCP2P22307 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCP2P22307 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCP2P22307 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCP2P22307 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCP2P22307 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCP2P22307 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCP2P22307 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SCP2P22307 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCP2P22307 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCP2P22307 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCP2P22307 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCP2P22307 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCP2P22307 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCP2P22307 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCP2P22307 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCP2P22307 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCP2P22307 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCP2P22307 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCP2P22307 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCP2P22307 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCP2P22307 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCP2P22307 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCP2P22307 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SCP2P22307 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCP2P22307 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SCP2P22307 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCP2P22307 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCP2P22307 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCP2P22307 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCP2P22307 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCP2P22307 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCP2P22307 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCP2P22307 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCP2P22307 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCP2P22307 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCP2P22307 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCP2P22307 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCP2P22307 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCP2P22307 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCP2P22307 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCP2P22307 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCP2P22307 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCP2P22307 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCP2P22307 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCP2P22307 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCP2P22307 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCP2P22307 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCP2P22307 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCP2P22307 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCP2P22307 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCP2P22307 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCP2P22307 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCP2P22307 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCP2P22307 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCP2P22307 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCP2P22307 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SCP2P22307 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCP2P22307 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms