Protein–RNA interactions for Protein: P22001

KCNA3, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA3P22001 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNA3P22001 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNA3P22001 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNA3P22001 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNA3P22001 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNA3P22001 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNA3P22001 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNA3P22001 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms