Protein–RNA interactions for Protein: P20749

BCL3, B-cell lymphoma 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL3P20749 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BCL3P20749 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BCL3P20749 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BCL3P20749 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BCL3P20749 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BCL3P20749 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BCL3P20749 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BCL3P20749 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BCL3P20749 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BCL3P20749 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BCL3P20749 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BCL3P20749 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BCL3P20749 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BCL3P20749 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BCL3P20749 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BCL3P20749 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BCL3P20749 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BCL3P20749 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BCL3P20749 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BCL3P20749 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BCL3P20749 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BCL3P20749 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BCL3P20749 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BCL3P20749 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BCL3P20749 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BCL3P20749 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BCL3P20749 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BCL3P20749 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BCL3P20749 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BCL3P20749 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BCL3P20749 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BCL3P20749 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BCL3P20749 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BCL3P20749 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BCL3P20749 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BCL3P20749 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BCL3P20749 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BCL3P20749 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BCL3P20749 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BCL3P20749 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BCL3P20749 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BCL3P20749 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BCL3P20749 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BCL3P20749 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BCL3P20749 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BCL3P20749 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BCL3P20749 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BCL3P20749 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BCL3P20749 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BCL3P20749 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BCL3P20749 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BCL3P20749 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BCL3P20749 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BCL3P20749 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BCL3P20749 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BCL3P20749 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BCL3P20749 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BCL3P20749 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BCL3P20749 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BCL3P20749 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BCL3P20749 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BCL3P20749 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BCL3P20749 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BCL3P20749 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BCL3P20749 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BCL3P20749 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BCL3P20749 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BCL3P20749 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BCL3P20749 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BCL3P20749 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BCL3P20749 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BCL3P20749 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BCL3P20749 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BCL3P20749 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BCL3P20749 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BCL3P20749 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BCL3P20749 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BCL3P20749 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCL3P20749 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCL3P20749 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCL3P20749 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCL3P20749 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCL3P20749 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCL3P20749 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCL3P20749 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCL3P20749 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCL3P20749 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCL3P20749 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCL3P20749 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCL3P20749 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCL3P20749 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCL3P20749 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCL3P20749 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCL3P20749 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCL3P20749 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCL3P20749 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCL3P20749 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCL3P20749 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCL3P20749 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCL3P20749 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms