Protein–RNA interactions for Protein: P20674

COX5A, Cytochrome c oxidase subunit 5A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX5AP20674 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
COX5AP20674 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
COX5AP20674 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX5AP20674 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX5AP20674 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX5AP20674 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX5AP20674 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
COX5AP20674 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
COX5AP20674 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX5AP20674 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX5AP20674 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX5AP20674 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX5AP20674 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX5AP20674 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX5AP20674 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX5AP20674 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX5AP20674 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX5AP20674 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX5AP20674 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX5AP20674 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX5AP20674 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX5AP20674 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX5AP20674 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX5AP20674 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX5AP20674 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX5AP20674 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX5AP20674 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX5AP20674 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX5AP20674 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX5AP20674 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX5AP20674 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX5AP20674 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX5AP20674 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX5AP20674 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX5AP20674 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX5AP20674 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX5AP20674 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX5AP20674 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX5AP20674 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX5AP20674 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX5AP20674 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX5AP20674 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX5AP20674 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX5AP20674 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX5AP20674 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX5AP20674 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX5AP20674 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX5AP20674 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX5AP20674 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX5AP20674 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX5AP20674 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX5AP20674 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX5AP20674 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX5AP20674 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
COX5AP20674 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
COX5AP20674 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX5AP20674 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX5AP20674 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX5AP20674 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX5AP20674 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX5AP20674 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX5AP20674 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX5AP20674 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COX5AP20674 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COX5AP20674 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COX5AP20674 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COX5AP20674 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COX5AP20674 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COX5AP20674 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COX5AP20674 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COX5AP20674 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COX5AP20674 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COX5AP20674 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COX5AP20674 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COX5AP20674 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COX5AP20674 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COX5AP20674 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COX5AP20674 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COX5AP20674 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COX5AP20674 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COX5AP20674 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COX5AP20674 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COX5AP20674 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COX5AP20674 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COX5AP20674 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COX5AP20674 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COX5AP20674 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COX5AP20674 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COX5AP20674 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COX5AP20674 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COX5AP20674 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COX5AP20674 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COX5AP20674 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COX5AP20674 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COX5AP20674 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COX5AP20674 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COX5AP20674 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COX5AP20674 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COX5AP20674 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COX5AP20674 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms