Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms