Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms