Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRF1P14222 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRF1P14222 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRF1P14222 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRF1P14222 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRF1P14222 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRF1P14222 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRF1P14222 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRF1P14222 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRF1P14222 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRF1P14222 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRF1P14222 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRF1P14222 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRF1P14222 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRF1P14222 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRF1P14222 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRF1P14222 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRF1P14222 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRF1P14222 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRF1P14222 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRF1P14222 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRF1P14222 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRF1P14222 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRF1P14222 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PRF1P14222 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRF1P14222 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PRF1P14222 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRF1P14222 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRF1P14222 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRF1P14222 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRF1P14222 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRF1P14222 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRF1P14222 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRF1P14222 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRF1P14222 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRF1P14222 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRF1P14222 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRF1P14222 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRF1P14222 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRF1P14222 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRF1P14222 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRF1P14222 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRF1P14222 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRF1P14222 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRF1P14222 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRF1P14222 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRF1P14222 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRF1P14222 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRF1P14222 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRF1P14222 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRF1P14222 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRF1P14222 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRF1P14222 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PRF1P14222 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRF1P14222 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRF1P14222 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRF1P14222 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRF1P14222 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRF1P14222 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRF1P14222 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRF1P14222 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRF1P14222 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRF1P14222 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRF1P14222 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRF1P14222 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRF1P14222 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRF1P14222 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRF1P14222 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRF1P14222 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRF1P14222 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRF1P14222 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRF1P14222 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRF1P14222 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRF1P14222 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRF1P14222 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRF1P14222 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRF1P14222 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRF1P14222 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRF1P14222 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRF1P14222 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PRF1P14222 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PRF1P14222 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRF1P14222 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRF1P14222 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRF1P14222 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRF1P14222 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PRF1P14222 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PRF1P14222 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PRF1P14222 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRF1P14222 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRF1P14222 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRF1P14222 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRF1P14222 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRF1P14222 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRF1P14222 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRF1P14222 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRF1P14222 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRF1P14222 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRF1P14222 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRF1P14222 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms