Protein–RNA interactions for Protein: P11142

HSPA8, Heat shock cognate 71 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 646 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA8P11142 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPA8P11142 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPA8P11142 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPA8P11142 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPA8P11142 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPA8P11142 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPA8P11142 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPA8P11142 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPA8P11142 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPA8P11142 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPA8P11142 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPA8P11142 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPA8P11142 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPA8P11142 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPA8P11142 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPA8P11142 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPA8P11142 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPA8P11142 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPA8P11142 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPA8P11142 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPA8P11142 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSPA8P11142 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSPA8P11142 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSPA8P11142 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSPA8P11142 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSPA8P11142 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSPA8P11142 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSPA8P11142 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSPA8P11142 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSPA8P11142 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSPA8P11142 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSPA8P11142 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSPA8P11142 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSPA8P11142 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSPA8P11142 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSPA8P11142 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSPA8P11142 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSPA8P11142 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HSPA8P11142 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HSPA8P11142 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HSPA8P11142 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HSPA8P11142 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HSPA8P11142 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSPA8P11142 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSPA8P11142 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSPA8P11142 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HSPA8P11142 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HSPA8P11142 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSPA8P11142 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HSPA8P11142 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HSPA8P11142 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HSPA8P11142 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSPA8P11142 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HSPA8P11142 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSPA8P11142 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HSPA8P11142 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSPA8P11142 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HSPA8P11142 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSPA8P11142 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSPA8P11142 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSPA8P11142 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSPA8P11142 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSPA8P11142 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPA8P11142 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPA8P11142 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPA8P11142 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPA8P11142 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPA8P11142 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPA8P11142 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPA8P11142 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPA8P11142 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPA8P11142 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPA8P11142 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPA8P11142 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPA8P11142 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSPA8P11142 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSPA8P11142 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSPA8P11142 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSPA8P11142 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSPA8P11142 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HSPA8P11142 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSPA8P11142 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSPA8P11142 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSPA8P11142 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSPA8P11142 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSPA8P11142 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSPA8P11142 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSPA8P11142 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HSPA8P11142 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSPA8P11142 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSPA8P11142 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSPA8P11142 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSPA8P11142 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSPA8P11142 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSPA8P11142 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSPA8P11142 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSPA8P11142 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSPA8P11142 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSPA8P11142 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSPA8P11142 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms