Protein–RNA interactions for Protein: P10747

CD28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD28P10747 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CD28P10747 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD28P10747 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD28P10747 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD28P10747 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD28P10747 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD28P10747 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD28P10747 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD28P10747 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD28P10747 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CD28P10747 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD28P10747 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CD28P10747 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD28P10747 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD28P10747 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD28P10747 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD28P10747 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD28P10747 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD28P10747 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD28P10747 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD28P10747 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD28P10747 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD28P10747 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD28P10747 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD28P10747 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD28P10747 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CD28P10747 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD28P10747 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD28P10747 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD28P10747 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD28P10747 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD28P10747 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD28P10747 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD28P10747 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD28P10747 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD28P10747 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD28P10747 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD28P10747 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD28P10747 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD28P10747 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD28P10747 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CD28P10747 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CD28P10747 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD28P10747 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD28P10747 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CD28P10747 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD28P10747 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD28P10747 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CD28P10747 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD28P10747 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD28P10747 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD28P10747 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD28P10747 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD28P10747 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD28P10747 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD28P10747 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD28P10747 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD28P10747 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD28P10747 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD28P10747 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD28P10747 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD28P10747 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD28P10747 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD28P10747 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD28P10747 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD28P10747 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD28P10747 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD28P10747 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD28P10747 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD28P10747 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD28P10747 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CD28P10747 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD28P10747 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD28P10747 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD28P10747 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CD28P10747 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD28P10747 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD28P10747 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD28P10747 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD28P10747 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD28P10747 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CD28P10747 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD28P10747 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD28P10747 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD28P10747 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD28P10747 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD28P10747 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD28P10747 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD28P10747 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD28P10747 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD28P10747 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD28P10747 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD28P10747 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD28P10747 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD28P10747 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD28P10747 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD28P10747 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD28P10747 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD28P10747 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD28P10747 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms