Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GLI3P10071 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GLI3P10071 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GLI3P10071 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GLI3P10071 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GLI3P10071 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GLI3P10071 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GLI3P10071 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GLI3P10071 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GLI3P10071 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GLI3P10071 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GLI3P10071 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GLI3P10071 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GLI3P10071 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GLI3P10071 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GLI3P10071 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GLI3P10071 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GLI3P10071 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GLI3P10071 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GLI3P10071 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GLI3P10071 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GLI3P10071 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
GLI3P10071 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
GLI3P10071 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
GLI3P10071 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
GLI3P10071 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GLI3P10071 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
GLI3P10071 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GLI3P10071 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GLI3P10071 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GLI3P10071 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GLI3P10071 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GLI3P10071 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GLI3P10071 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GLI3P10071 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GLI3P10071 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GLI3P10071 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GLI3P10071 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GLI3P10071 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GLI3P10071 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
GLI3P10071 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GLI3P10071 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GLI3P10071 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GLI3P10071 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GLI3P10071 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GLI3P10071 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GLI3P10071 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
GLI3P10071 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GLI3P10071 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GLI3P10071 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GLI3P10071 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GLI3P10071 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GLI3P10071 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GLI3P10071 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GLI3P10071 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GLI3P10071 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GLI3P10071 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GLI3P10071 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GLI3P10071 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GLI3P10071 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GLI3P10071 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GLI3P10071 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GLI3P10071 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GLI3P10071 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GLI3P10071 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GLI3P10071 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GLI3P10071 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GLI3P10071 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GLI3P10071 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GLI3P10071 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GLI3P10071 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
GLI3P10071 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GLI3P10071 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
GLI3P10071 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GLI3P10071 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GLI3P10071 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GLI3P10071 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GLI3P10071 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GLI3P10071 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GLI3P10071 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GLI3P10071 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GLI3P10071 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GLI3P10071 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GLI3P10071 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GLI3P10071 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GLI3P10071 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GLI3P10071 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GLI3P10071 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GLI3P10071 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GLI3P10071 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GLI3P10071 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GLI3P10071 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GLI3P10071 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GLI3P10071 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GLI3P10071 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GLI3P10071 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GLI3P10071 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GLI3P10071 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GLI3P10071 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
GLI3P10071 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms