Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms