Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPM2P07951 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPM2P07951 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPM2P07951 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPM2P07951 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPM2P07951 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPM2P07951 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPM2P07951 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPM2P07951 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPM2P07951 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPM2P07951 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPM2P07951 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPM2P07951 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPM2P07951 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPM2P07951 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPM2P07951 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPM2P07951 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPM2P07951 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPM2P07951 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPM2P07951 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPM2P07951 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPM2P07951 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPM2P07951 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPM2P07951 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPM2P07951 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPM2P07951 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPM2P07951 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPM2P07951 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPM2P07951 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPM2P07951 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPM2P07951 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPM2P07951 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPM2P07951 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPM2P07951 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPM2P07951 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPM2P07951 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPM2P07951 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TPM2P07951 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPM2P07951 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPM2P07951 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPM2P07951 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPM2P07951 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPM2P07951 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPM2P07951 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPM2P07951 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPM2P07951 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPM2P07951 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPM2P07951 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPM2P07951 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPM2P07951 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPM2P07951 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPM2P07951 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPM2P07951 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPM2P07951 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPM2P07951 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPM2P07951 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPM2P07951 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TPM2P07951 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPM2P07951 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPM2P07951 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPM2P07951 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPM2P07951 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPM2P07951 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPM2P07951 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPM2P07951 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPM2P07951 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPM2P07951 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPM2P07951 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TPM2P07951 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TPM2P07951 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPM2P07951 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPM2P07951 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TPM2P07951 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TPM2P07951 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TPM2P07951 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TPM2P07951 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TPM2P07951 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TPM2P07951 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
TPM2P07951 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
TPM2P07951 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TPM2P07951 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TPM2P07951 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TPM2P07951 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TPM2P07951 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPM2P07951 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPM2P07951 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPM2P07951 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPM2P07951 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPM2P07951 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPM2P07951 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPM2P07951 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPM2P07951 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPM2P07951 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPM2P07951 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPM2P07951 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPM2P07951 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPM2P07951 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPM2P07951 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPM2P07951 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPM2P07951 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms