Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CENPBP07199 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CENPBP07199 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CENPBP07199 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CENPBP07199 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CENPBP07199 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CENPBP07199 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CENPBP07199 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CENPBP07199 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CENPBP07199 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CENPBP07199 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CENPBP07199 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CENPBP07199 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CENPBP07199 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CENPBP07199 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CENPBP07199 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CENPBP07199 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CENPBP07199 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CENPBP07199 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CENPBP07199 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CENPBP07199 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CENPBP07199 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CENPBP07199 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CENPBP07199 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CENPBP07199 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CENPBP07199 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CENPBP07199 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CENPBP07199 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CENPBP07199 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CENPBP07199 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CENPBP07199 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CENPBP07199 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CENPBP07199 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CENPBP07199 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CENPBP07199 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CENPBP07199 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CENPBP07199 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CENPBP07199 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CENPBP07199 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CENPBP07199 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CENPBP07199 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CENPBP07199 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CENPBP07199 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CENPBP07199 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CENPBP07199 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CENPBP07199 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CENPBP07199 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CENPBP07199 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CENPBP07199 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CENPBP07199 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CENPBP07199 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CENPBP07199 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CENPBP07199 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CENPBP07199 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CENPBP07199 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CENPBP07199 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CENPBP07199 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CENPBP07199 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CENPBP07199 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CENPBP07199 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CENPBP07199 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CENPBP07199 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CENPBP07199 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CENPBP07199 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CENPBP07199 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CENPBP07199 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CENPBP07199 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CENPBP07199 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CENPBP07199 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CENPBP07199 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CENPBP07199 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CENPBP07199 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CENPBP07199 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CENPBP07199 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CENPBP07199 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CENPBP07199 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CENPBP07199 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CENPBP07199 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CENPBP07199 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CENPBP07199 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CENPBP07199 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CENPBP07199 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CENPBP07199 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CENPBP07199 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CENPBP07199 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CENPBP07199 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CENPBP07199 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CENPBP07199 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CENPBP07199 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CENPBP07199 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CENPBP07199 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CENPBP07199 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CENPBP07199 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CENPBP07199 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CENPBP07199 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CENPBP07199 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CENPBP07199 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CENPBP07199 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CENPBP07199 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CENPBP07199 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms