Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms