Protein–RNA interactions for Protein: P01008

SERPINC1, Antithrombin-III, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINC1P01008 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SERPINC1P01008 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SERPINC1P01008 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SERPINC1P01008 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SERPINC1P01008 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SERPINC1P01008 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SERPINC1P01008 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SERPINC1P01008 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SERPINC1P01008 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SERPINC1P01008 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SERPINC1P01008 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SERPINC1P01008 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SERPINC1P01008 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SERPINC1P01008 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SERPINC1P01008 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SERPINC1P01008 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SERPINC1P01008 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SERPINC1P01008 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SERPINC1P01008 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SERPINC1P01008 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SERPINC1P01008 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SERPINC1P01008 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SERPINC1P01008 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SERPINC1P01008 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SERPINC1P01008 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SERPINC1P01008 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SERPINC1P01008 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SERPINC1P01008 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SERPINC1P01008 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SERPINC1P01008 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SERPINC1P01008 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SERPINC1P01008 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SERPINC1P01008 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SERPINC1P01008 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SERPINC1P01008 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SERPINC1P01008 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SERPINC1P01008 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SERPINC1P01008 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SERPINC1P01008 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SERPINC1P01008 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SERPINC1P01008 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SERPINC1P01008 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SERPINC1P01008 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SERPINC1P01008 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SERPINC1P01008 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SERPINC1P01008 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SERPINC1P01008 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SERPINC1P01008 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SERPINC1P01008 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SERPINC1P01008 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SERPINC1P01008 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SERPINC1P01008 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SERPINC1P01008 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SERPINC1P01008 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SERPINC1P01008 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SERPINC1P01008 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SERPINC1P01008 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SERPINC1P01008 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SERPINC1P01008 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SERPINC1P01008 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SERPINC1P01008 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SERPINC1P01008 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SERPINC1P01008 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SERPINC1P01008 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SERPINC1P01008 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SERPINC1P01008 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SERPINC1P01008 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SERPINC1P01008 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SERPINC1P01008 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SERPINC1P01008 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SERPINC1P01008 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SERPINC1P01008 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SERPINC1P01008 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SERPINC1P01008 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SERPINC1P01008 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SERPINC1P01008 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SERPINC1P01008 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SERPINC1P01008 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SERPINC1P01008 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SERPINC1P01008 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SERPINC1P01008 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SERPINC1P01008 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SERPINC1P01008 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SERPINC1P01008 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SERPINC1P01008 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SERPINC1P01008 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SERPINC1P01008 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SERPINC1P01008 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SERPINC1P01008 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SERPINC1P01008 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SERPINC1P01008 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SERPINC1P01008 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SERPINC1P01008 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SERPINC1P01008 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SERPINC1P01008 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SERPINC1P01008 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SERPINC1P01008 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SERPINC1P01008 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SERPINC1P01008 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SERPINC1P01008 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms