Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYF2O95926 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYF2O95926 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYF2O95926 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYF2O95926 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYF2O95926 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYF2O95926 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYF2O95926 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYF2O95926 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYF2O95926 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYF2O95926 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYF2O95926 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYF2O95926 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYF2O95926 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYF2O95926 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYF2O95926 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYF2O95926 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYF2O95926 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYF2O95926 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYF2O95926 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYF2O95926 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYF2O95926 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYF2O95926 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYF2O95926 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYF2O95926 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYF2O95926 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYF2O95926 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYF2O95926 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYF2O95926 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYF2O95926 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYF2O95926 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYF2O95926 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYF2O95926 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYF2O95926 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYF2O95926 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SYF2O95926 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYF2O95926 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYF2O95926 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYF2O95926 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SYF2O95926 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYF2O95926 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYF2O95926 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYF2O95926 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYF2O95926 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYF2O95926 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYF2O95926 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYF2O95926 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYF2O95926 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYF2O95926 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYF2O95926 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYF2O95926 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYF2O95926 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYF2O95926 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYF2O95926 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYF2O95926 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYF2O95926 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYF2O95926 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYF2O95926 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYF2O95926 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYF2O95926 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYF2O95926 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYF2O95926 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYF2O95926 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYF2O95926 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYF2O95926 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYF2O95926 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYF2O95926 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYF2O95926 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYF2O95926 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYF2O95926 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYF2O95926 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYF2O95926 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYF2O95926 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYF2O95926 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYF2O95926 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYF2O95926 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYF2O95926 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYF2O95926 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYF2O95926 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYF2O95926 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYF2O95926 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYF2O95926 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYF2O95926 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYF2O95926 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYF2O95926 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYF2O95926 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
SYF2O95926 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
SYF2O95926 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYF2O95926 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYF2O95926 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYF2O95926 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYF2O95926 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYF2O95926 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYF2O95926 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYF2O95926 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYF2O95926 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYF2O95926 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYF2O95926 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYF2O95926 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYF2O95926 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms