Protein–RNA interactions for Protein: O94759

TRPM2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM2O94759 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms