Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRMUO75648 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRMUO75648 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRMUO75648 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRMUO75648 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRMUO75648 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRMUO75648 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRMUO75648 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRMUO75648 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRMUO75648 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRMUO75648 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRMUO75648 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRMUO75648 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRMUO75648 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TRMUO75648 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRMUO75648 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRMUO75648 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TRMUO75648 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRMUO75648 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TRMUO75648 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TRMUO75648 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRMUO75648 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRMUO75648 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRMUO75648 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRMUO75648 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRMUO75648 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRMUO75648 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRMUO75648 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRMUO75648 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRMUO75648 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRMUO75648 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRMUO75648 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRMUO75648 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRMUO75648 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRMUO75648 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRMUO75648 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRMUO75648 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRMUO75648 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRMUO75648 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRMUO75648 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRMUO75648 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRMUO75648 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRMUO75648 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRMUO75648 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRMUO75648 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRMUO75648 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRMUO75648 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRMUO75648 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRMUO75648 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRMUO75648 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRMUO75648 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRMUO75648 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRMUO75648 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRMUO75648 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRMUO75648 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRMUO75648 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRMUO75648 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TRMUO75648 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRMUO75648 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRMUO75648 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRMUO75648 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRMUO75648 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRMUO75648 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRMUO75648 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRMUO75648 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRMUO75648 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRMUO75648 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRMUO75648 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRMUO75648 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRMUO75648 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRMUO75648 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRMUO75648 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRMUO75648 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRMUO75648 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRMUO75648 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRMUO75648 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRMUO75648 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRMUO75648 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRMUO75648 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRMUO75648 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRMUO75648 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRMUO75648 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRMUO75648 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRMUO75648 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRMUO75648 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRMUO75648 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRMUO75648 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRMUO75648 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRMUO75648 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRMUO75648 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRMUO75648 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRMUO75648 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRMUO75648 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRMUO75648 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRMUO75648 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRMUO75648 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRMUO75648 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRMUO75648 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRMUO75648 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRMUO75648 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms