Protein–RNA interactions for Protein: O75346

ZNF253, Zinc finger protein 253, humanhuman

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF253O75346 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF253O75346 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF253O75346 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF253O75346 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF253O75346 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF253O75346 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF253O75346 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF253O75346 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF253O75346 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF253O75346 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF253O75346 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF253O75346 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF253O75346 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF253O75346 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF253O75346 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF253O75346 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF253O75346 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF253O75346 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF253O75346 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF253O75346 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF253O75346 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF253O75346 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF253O75346 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF253O75346 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF253O75346 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF253O75346 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF253O75346 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF253O75346 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF253O75346 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF253O75346 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF253O75346 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF253O75346 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF253O75346 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF253O75346 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF253O75346 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF253O75346 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF253O75346 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF253O75346 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF253O75346 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF253O75346 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF253O75346 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF253O75346 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF253O75346 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF253O75346 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF253O75346 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF253O75346 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF253O75346 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF253O75346 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF253O75346 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF253O75346 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF253O75346 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF253O75346 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF253O75346 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF253O75346 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF253O75346 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF253O75346 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF253O75346 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF253O75346 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF253O75346 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF253O75346 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF253O75346 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF253O75346 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF253O75346 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF253O75346 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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ZNF253O75346 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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ZNF253O75346 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF253O75346 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF253O75346 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF253O75346 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF253O75346 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF253O75346 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF253O75346 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF253O75346 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF253O75346 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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