Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SIN3BO75182 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SIN3BO75182 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SIN3BO75182 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SIN3BO75182 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SIN3BO75182 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SIN3BO75182 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SIN3BO75182 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SIN3BO75182 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SIN3BO75182 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SIN3BO75182 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIN3BO75182 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SIN3BO75182 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIN3BO75182 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIN3BO75182 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIN3BO75182 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SIN3BO75182 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIN3BO75182 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIN3BO75182 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIN3BO75182 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIN3BO75182 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIN3BO75182 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SIN3BO75182 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIN3BO75182 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIN3BO75182 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIN3BO75182 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SIN3BO75182 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SIN3BO75182 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIN3BO75182 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIN3BO75182 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIN3BO75182 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIN3BO75182 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIN3BO75182 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIN3BO75182 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIN3BO75182 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIN3BO75182 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIN3BO75182 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIN3BO75182 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIN3BO75182 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIN3BO75182 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIN3BO75182 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIN3BO75182 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIN3BO75182 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIN3BO75182 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIN3BO75182 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIN3BO75182 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SIN3BO75182 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIN3BO75182 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SIN3BO75182 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIN3BO75182 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIN3BO75182 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIN3BO75182 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SIN3BO75182 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SIN3BO75182 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIN3BO75182 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIN3BO75182 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIN3BO75182 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIN3BO75182 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SIN3BO75182 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIN3BO75182 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SIN3BO75182 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIN3BO75182 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIN3BO75182 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIN3BO75182 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIN3BO75182 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SIN3BO75182 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIN3BO75182 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIN3BO75182 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIN3BO75182 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIN3BO75182 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIN3BO75182 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIN3BO75182 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIN3BO75182 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIN3BO75182 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIN3BO75182 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIN3BO75182 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIN3BO75182 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIN3BO75182 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIN3BO75182 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIN3BO75182 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIN3BO75182 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIN3BO75182 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms