Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB11FIP3O75154 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB11FIP3O75154 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB11FIP3O75154 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB11FIP3O75154 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB11FIP3O75154 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB11FIP3O75154 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB11FIP3O75154 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB11FIP3O75154 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB11FIP3O75154 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB11FIP3O75154 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB11FIP3O75154 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RAB11FIP3O75154 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB11FIP3O75154 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB11FIP3O75154 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB11FIP3O75154 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RAB11FIP3O75154 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB11FIP3O75154 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB11FIP3O75154 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB11FIP3O75154 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RAB11FIP3O75154 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB11FIP3O75154 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB11FIP3O75154 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RAB11FIP3O75154 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RAB11FIP3O75154 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB11FIP3O75154 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RAB11FIP3O75154 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RAB11FIP3O75154 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB11FIP3O75154 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RAB11FIP3O75154 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RAB11FIP3O75154 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB11FIP3O75154 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB11FIP3O75154 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB11FIP3O75154 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB11FIP3O75154 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB11FIP3O75154 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB11FIP3O75154 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB11FIP3O75154 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB11FIP3O75154 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB11FIP3O75154 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB11FIP3O75154 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB11FIP3O75154 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB11FIP3O75154 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB11FIP3O75154 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB11FIP3O75154 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB11FIP3O75154 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB11FIP3O75154 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB11FIP3O75154 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB11FIP3O75154 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB11FIP3O75154 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB11FIP3O75154 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB11FIP3O75154 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB11FIP3O75154 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB11FIP3O75154 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB11FIP3O75154 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB11FIP3O75154 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB11FIP3O75154 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB11FIP3O75154 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB11FIP3O75154 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB11FIP3O75154 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB11FIP3O75154 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB11FIP3O75154 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB11FIP3O75154 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB11FIP3O75154 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB11FIP3O75154 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB11FIP3O75154 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB11FIP3O75154 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB11FIP3O75154 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB11FIP3O75154 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB11FIP3O75154 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms