Protein–RNA interactions for Protein: O60826

CCDC22, Coiled-coil domain-containing protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC22O60826 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC22O60826 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC22O60826 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC22O60826 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC22O60826 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC22O60826 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC22O60826 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC22O60826 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC22O60826 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC22O60826 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC22O60826 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC22O60826 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC22O60826 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC22O60826 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC22O60826 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC22O60826 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms