Protein–RNA interactions for Protein: O60220

TIMM8A, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim8 A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM8AO60220 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TIMM8AO60220 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TIMM8AO60220 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TIMM8AO60220 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TIMM8AO60220 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TIMM8AO60220 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TIMM8AO60220 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TIMM8AO60220 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms