Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCO2O43819 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCO2O43819 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCO2O43819 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCO2O43819 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCO2O43819 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCO2O43819 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCO2O43819 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCO2O43819 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCO2O43819 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCO2O43819 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCO2O43819 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCO2O43819 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCO2O43819 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCO2O43819 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCO2O43819 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCO2O43819 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCO2O43819 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCO2O43819 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCO2O43819 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SCO2O43819 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCO2O43819 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCO2O43819 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCO2O43819 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCO2O43819 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCO2O43819 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCO2O43819 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCO2O43819 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCO2O43819 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SCO2O43819 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCO2O43819 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCO2O43819 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCO2O43819 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCO2O43819 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCO2O43819 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCO2O43819 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCO2O43819 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCO2O43819 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCO2O43819 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SCO2O43819 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCO2O43819 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCO2O43819 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCO2O43819 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCO2O43819 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCO2O43819 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCO2O43819 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCO2O43819 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCO2O43819 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCO2O43819 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCO2O43819 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCO2O43819 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCO2O43819 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SCO2O43819 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SCO2O43819 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SCO2O43819 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCO2O43819 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCO2O43819 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCO2O43819 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCO2O43819 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCO2O43819 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCO2O43819 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCO2O43819 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCO2O43819 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SCO2O43819 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SCO2O43819 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCO2O43819 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCO2O43819 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCO2O43819 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCO2O43819 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCO2O43819 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCO2O43819 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCO2O43819 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCO2O43819 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCO2O43819 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SCO2O43819 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCO2O43819 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCO2O43819 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCO2O43819 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCO2O43819 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCO2O43819 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCO2O43819 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCO2O43819 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCO2O43819 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCO2O43819 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCO2O43819 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCO2O43819 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCO2O43819 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCO2O43819 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCO2O43819 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SCO2O43819 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCO2O43819 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCO2O43819 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCO2O43819 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCO2O43819 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCO2O43819 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCO2O43819 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCO2O43819 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCO2O43819 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCO2O43819 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCO2O43819 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms