Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DENRO43583 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DENRO43583 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DENRO43583 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DENRO43583 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DENRO43583 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DENRO43583 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DENRO43583 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DENRO43583 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DENRO43583 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DENRO43583 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DENRO43583 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DENRO43583 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DENRO43583 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DENRO43583 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DENRO43583 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DENRO43583 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DENRO43583 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DENRO43583 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DENRO43583 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DENRO43583 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DENRO43583 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DENRO43583 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DENRO43583 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DENRO43583 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DENRO43583 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DENRO43583 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DENRO43583 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DENRO43583 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DENRO43583 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DENRO43583 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DENRO43583 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DENRO43583 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DENRO43583 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DENRO43583 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DENRO43583 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DENRO43583 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DENRO43583 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DENRO43583 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DENRO43583 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DENRO43583 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DENRO43583 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DENRO43583 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DENRO43583 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DENRO43583 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DENRO43583 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DENRO43583 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DENRO43583 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DENRO43583 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DENRO43583 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DENRO43583 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DENRO43583 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DENRO43583 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DENRO43583 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DENRO43583 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DENRO43583 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DENRO43583 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DENRO43583 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DENRO43583 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DENRO43583 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DENRO43583 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DENRO43583 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DENRO43583 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DENRO43583 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DENRO43583 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DENRO43583 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DENRO43583 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DENRO43583 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DENRO43583 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
DENRO43583 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DENRO43583 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DENRO43583 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DENRO43583 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DENRO43583 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DENRO43583 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DENRO43583 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DENRO43583 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DENRO43583 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DENRO43583 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DENRO43583 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DENRO43583 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DENRO43583 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DENRO43583 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DENRO43583 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DENRO43583 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DENRO43583 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DENRO43583 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DENRO43583 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DENRO43583 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DENRO43583 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DENRO43583 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DENRO43583 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DENRO43583 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DENRO43583 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DENRO43583 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DENRO43583 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DENRO43583 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DENRO43583 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DENRO43583 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DENRO43583 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms