Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms