Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBDO15205 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBDO15205 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBDO15205 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBDO15205 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBDO15205 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBDO15205 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBDO15205 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBDO15205 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBDO15205 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBDO15205 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBDO15205 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBDO15205 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBDO15205 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBDO15205 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBDO15205 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBDO15205 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBDO15205 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBDO15205 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBDO15205 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBDO15205 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
UBDO15205 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBDO15205 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBDO15205 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBDO15205 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBDO15205 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBDO15205 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBDO15205 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBDO15205 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBDO15205 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBDO15205 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBDO15205 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBDO15205 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBDO15205 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBDO15205 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBDO15205 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBDO15205 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBDO15205 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBDO15205 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBDO15205 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBDO15205 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBDO15205 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBDO15205 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBDO15205 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBDO15205 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
UBDO15205 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBDO15205 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBDO15205 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBDO15205 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBDO15205 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBDO15205 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBDO15205 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBDO15205 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBDO15205 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBDO15205 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBDO15205 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBDO15205 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBDO15205 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
UBDO15205 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
UBDO15205 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
UBDO15205 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
UBDO15205 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
UBDO15205 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
UBDO15205 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
UBDO15205 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
UBDO15205 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
UBDO15205 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
UBDO15205 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
UBDO15205 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
UBDO15205 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
UBDO15205 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
UBDO15205 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
UBDO15205 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
UBDO15205 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
UBDO15205 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
UBDO15205 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
UBDO15205 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
UBDO15205 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
UBDO15205 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
UBDO15205 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
UBDO15205 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
UBDO15205 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
UBDO15205 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
UBDO15205 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
UBDO15205 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
UBDO15205 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
UBDO15205 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
UBDO15205 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
UBDO15205 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
UBDO15205 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
UBDO15205 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
UBDO15205 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
UBDO15205 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
UBDO15205 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
UBDO15205 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
UBDO15205 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
UBDO15205 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
UBDO15205 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
UBDO15205 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
UBDO15205 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms