Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASKO14936 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASKO14936 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASKO14936 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASKO14936 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASKO14936 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASKO14936 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASKO14936 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASKO14936 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASKO14936 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CASKO14936 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASKO14936 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASKO14936 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASKO14936 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASKO14936 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASKO14936 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASKO14936 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASKO14936 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASKO14936 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASKO14936 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASKO14936 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASKO14936 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASKO14936 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASKO14936 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASKO14936 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASKO14936 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASKO14936 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CASKO14936 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASKO14936 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASKO14936 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASKO14936 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASKO14936 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASKO14936 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASKO14936 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASKO14936 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASKO14936 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASKO14936 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASKO14936 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASKO14936 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASKO14936 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASKO14936 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASKO14936 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASKO14936 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASKO14936 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASKO14936 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASKO14936 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASKO14936 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASKO14936 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASKO14936 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASKO14936 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASKO14936 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASKO14936 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASKO14936 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASKO14936 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASKO14936 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASKO14936 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASKO14936 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASKO14936 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASKO14936 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASKO14936 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASKO14936 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASKO14936 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASKO14936 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASKO14936 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CASKO14936 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASKO14936 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASKO14936 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASKO14936 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASKO14936 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASKO14936 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASKO14936 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASKO14936 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASKO14936 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASKO14936 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASKO14936 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASKO14936 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASKO14936 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASKO14936 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASKO14936 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASKO14936 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASKO14936 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CASKO14936 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASKO14936 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASKO14936 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASKO14936 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASKO14936 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASKO14936 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASKO14936 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASKO14936 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASKO14936 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASKO14936 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASKO14936 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASKO14936 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASKO14936 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASKO14936 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASKO14936 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASKO14936 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASKO14936 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASKO14936 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASKO14936 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms