Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
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