Protein–RNA interactions for Protein: J3QLI3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QLI3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
J3QLI3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
J3QLI3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
J3QLI3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
J3QLI3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
J3QLI3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
J3QLI3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
J3QLI3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
J3QLI3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
J3QLI3 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
J3QLI3 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
J3QLI3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
J3QLI3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
J3QLI3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
J3QLI3 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
J3QLI3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
J3QLI3 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
J3QLI3 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
J3QLI3 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
J3QLI3 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
J3QLI3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
J3QLI3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
J3QLI3 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
J3QLI3 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
J3QLI3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
J3QLI3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
J3QLI3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
J3QLI3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
J3QLI3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
J3QLI3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
J3QLI3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
J3QLI3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
J3QLI3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
J3QLI3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
J3QLI3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
J3QLI3 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
J3QLI3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
J3QLI3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
J3QLI3 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
J3QLI3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
J3QLI3 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
J3QLI3 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
J3QLI3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
J3QLI3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
J3QLI3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
J3QLI3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
J3QLI3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
J3QLI3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
J3QLI3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
J3QLI3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
J3QLI3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3QLI3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
J3QLI3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3QLI3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3QLI3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3QLI3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3QLI3 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3QLI3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3QLI3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3QLI3 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3QLI3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3QLI3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3QLI3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
J3QLI3 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
J3QLI3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3QLI3 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3QLI3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
J3QLI3 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3QLI3 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
J3QLI3 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3QLI3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3QLI3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
J3QLI3 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
J3QLI3 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3QLI3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3QLI3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3QLI3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3QLI3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3QLI3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3QLI3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3QLI3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3QLI3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3QLI3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3QLI3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
J3QLI3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
J3QLI3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
J3QLI3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
J3QLI3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
J3QLI3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
J3QLI3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
J3QLI3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
J3QLI3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
J3QLI3 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
J3QLI3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
J3QLI3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
J3QLI3 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
J3QLI3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
J3QLI3 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
J3QLI3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
J3QLI3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms