Protein–RNA interactions for Protein: J3KT08

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KT08 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
J3KT08 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
J3KT08 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
J3KT08 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
J3KT08 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
J3KT08 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
J3KT08 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
J3KT08 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
J3KT08 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
J3KT08 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
J3KT08 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
J3KT08 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
J3KT08 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
J3KT08 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
J3KT08 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
J3KT08 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
J3KT08 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
J3KT08 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
J3KT08 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
J3KT08 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
J3KT08 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
J3KT08 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
J3KT08 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
J3KT08 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
J3KT08 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
J3KT08 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
J3KT08 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
J3KT08 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
J3KT08 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
J3KT08 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
J3KT08 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
J3KT08 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
J3KT08 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
J3KT08 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
J3KT08 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
J3KT08 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
J3KT08 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
J3KT08 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
J3KT08 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
J3KT08 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
J3KT08 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
J3KT08 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
J3KT08 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
J3KT08 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
J3KT08 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
J3KT08 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
J3KT08 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
J3KT08 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
J3KT08 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
J3KT08 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
J3KT08 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
J3KT08 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
J3KT08 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
J3KT08 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
J3KT08 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
J3KT08 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
J3KT08 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
J3KT08 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
J3KT08 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
J3KT08 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
J3KT08 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
J3KT08 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
J3KT08 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
J3KT08 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
J3KT08 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
J3KT08 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
J3KT08 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
J3KT08 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
J3KT08 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
J3KT08 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
J3KT08 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
J3KT08 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
J3KT08 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
J3KT08 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
J3KT08 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
J3KT08 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
J3KT08 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
J3KT08 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
J3KT08 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
J3KT08 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
J3KT08 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
J3KT08 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
J3KT08 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
J3KT08 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
J3KT08 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
J3KT08 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
J3KT08 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
J3KT08 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
J3KT08 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
J3KT08 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
J3KT08 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
J3KT08 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
J3KT08 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
J3KT08 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
J3KT08 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
J3KT08 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
J3KT08 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
J3KT08 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
J3KT08 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
J3KT08 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms