Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
E9PCH4 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
E9PCH4 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
E9PCH4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
E9PCH4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
E9PCH4 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
E9PCH4 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
E9PCH4 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
E9PCH4 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
E9PCH4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
E9PCH4 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
E9PCH4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
E9PCH4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
E9PCH4 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
E9PCH4 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
E9PCH4 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
E9PCH4 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
E9PCH4 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
E9PCH4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
E9PCH4 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
E9PCH4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
E9PCH4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
E9PCH4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
E9PCH4 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
E9PCH4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
E9PCH4 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
E9PCH4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
E9PCH4 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
E9PCH4 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
E9PCH4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
E9PCH4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
E9PCH4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
E9PCH4 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
E9PCH4 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
E9PCH4 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
E9PCH4 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
E9PCH4 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
E9PCH4 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
E9PCH4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
E9PCH4 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
E9PCH4 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
E9PCH4 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
E9PCH4 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
E9PCH4 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
E9PCH4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
E9PCH4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
E9PCH4 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
E9PCH4 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
E9PCH4 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
E9PCH4 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
E9PCH4 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
E9PCH4 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
E9PCH4 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
E9PCH4 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
E9PCH4 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
E9PCH4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
E9PCH4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
E9PCH4 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
E9PCH4 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
E9PCH4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
E9PCH4 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
E9PCH4 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
E9PCH4 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
E9PCH4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
E9PCH4 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
E9PCH4 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
E9PCH4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
E9PCH4 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
E9PCH4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
E9PCH4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
E9PCH4 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
E9PCH4 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
E9PCH4 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
E9PCH4 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
E9PCH4 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
E9PCH4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
E9PCH4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
E9PCH4 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
E9PCH4 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
E9PCH4 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
E9PCH4 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
E9PCH4 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
E9PCH4 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
E9PCH4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
E9PCH4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
E9PCH4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
E9PCH4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
E9PCH4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
E9PCH4 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
E9PCH4 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
E9PCH4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
E9PCH4 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
E9PCH4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
E9PCH4 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
E9PCH4 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
E9PCH4 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
E9PCH4 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
E9PCH4 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
E9PCH4 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
E9PCH4 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms