Protein–RNA interactions for Protein: C9JVI0

USP17L11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L11C9JVI0 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP17L11C9JVI0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP17L11C9JVI0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP17L11C9JVI0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP17L11C9JVI0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP17L11C9JVI0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP17L11C9JVI0 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP17L11C9JVI0 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP17L11C9JVI0 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP17L11C9JVI0 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP17L11C9JVI0 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP17L11C9JVI0 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP17L11C9JVI0 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP17L11C9JVI0 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP17L11C9JVI0 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP17L11C9JVI0 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP17L11C9JVI0 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP17L11C9JVI0 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
USP17L11C9JVI0 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP17L11C9JVI0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP17L11C9JVI0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP17L11C9JVI0 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP17L11C9JVI0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP17L11C9JVI0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP17L11C9JVI0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP17L11C9JVI0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP17L11C9JVI0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP17L11C9JVI0 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP17L11C9JVI0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP17L11C9JVI0 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP17L11C9JVI0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP17L11C9JVI0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP17L11C9JVI0 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP17L11C9JVI0 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP17L11C9JVI0 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP17L11C9JVI0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP17L11C9JVI0 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP17L11C9JVI0 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP17L11C9JVI0 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
USP17L11C9JVI0 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP17L11C9JVI0 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP17L11C9JVI0 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP17L11C9JVI0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP17L11C9JVI0 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP17L11C9JVI0 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP17L11C9JVI0 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP17L11C9JVI0 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP17L11C9JVI0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP17L11C9JVI0 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP17L11C9JVI0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP17L11C9JVI0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP17L11C9JVI0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP17L11C9JVI0 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP17L11C9JVI0 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
USP17L11C9JVI0 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP17L11C9JVI0 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP17L11C9JVI0 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP17L11C9JVI0 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP17L11C9JVI0 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP17L11C9JVI0 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP17L11C9JVI0 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP17L11C9JVI0 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP17L11C9JVI0 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP17L11C9JVI0 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
USP17L11C9JVI0 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP17L11C9JVI0 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
USP17L11C9JVI0 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP17L11C9JVI0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP17L11C9JVI0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP17L11C9JVI0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP17L11C9JVI0 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP17L11C9JVI0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP17L11C9JVI0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP17L11C9JVI0 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP17L11C9JVI0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
USP17L11C9JVI0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP17L11C9JVI0 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP17L11C9JVI0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP17L11C9JVI0 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP17L11C9JVI0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP17L11C9JVI0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms