Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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LINC00587B1AMM8 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00587B1AMM8 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00587B1AMM8 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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